RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193		A6NJY4	79 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00315	P59091	139 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193		F5H697	171 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	TSPAN13	O95857	204 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMB2	P49721	201 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	HTN1	P15515	57 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GRSF1-208	ENST00000545193	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		11.46	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.46	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	PTH2	Q96A98	100 aa		11.46	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.45	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2D1	P51668	147 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP1R17	O96001	155 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	STH	Q8IWL8	128 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0J9YY99	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	PRM2	P04554	102 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	CDIP1	Q9H305	208 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	PMVK	Q15126	192 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF183	Q96D59	192 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	INS	P01308	110 aa		11.42	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	MT-ATP8	P03928	68 aa		11.42	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXI1	Q12951	378 aa		11.42	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01587	Q99440	93 aa		11.42	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	HERVK_113	P61574	105 aa		11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	VCY	O14598	125 aa		11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.41	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
GRSF1-208	ENST00000545193	CRLF1	O75462	422 aa		11.4	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	CFC1B	P0CG36	223 aa		11.4	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	CFC1	P0CG37	223 aa		11.4	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF56	Q15929	161 aa		11.4	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.4	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	ERG28	Q9UKR5	140 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	TCL1B	O95988	128 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	PF4	P02776	101 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	XG	P55808	180 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2D3	P61077	147 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2D2	P62837	147 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.39	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		M0QY20	66 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R2P5	195 aa		11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		J3QQQ9	107 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZUT4	128 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		H7C2G1	150 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	AMELX	Q99217	191 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.35	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.35	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.35	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.35	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		A8MWV9	139 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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