RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 U3KQE9 123 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 GAGE2BQ13066 116 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE2EQ4V326 116 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 C3orf56Q8N813 242 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ESM1Q9NQ30 184 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 Q1RN00 199 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 DEFB136Q30KP8 78 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ZNF876PQ49A33 203 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SNCGO76070 127 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TTC32Q5I0X7 151 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.77□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 F5H697 171 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TMEM262E9PQX1 116 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SOCS3O14543 225 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRIAP1O43715 76 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 NPC2P61916 151 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LINC01620Q4KN68 170 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.76□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 HERV-K104P63124 156 aa6.75□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.75□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.75□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.75□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PRX2 142 aa6.75□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 VWFP04275 2813 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A0A0J9YXV3 536 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TMEM223A0PJW6 202 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12JA6NER3 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 INAFM1C9JVW0 142 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE7O76087 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LY6G6DO95868 133 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12FP0CL80 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12GP0CL81 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12IP0CL82 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 GAGE4Q13068 117 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 Q6YL49 198 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LINC00477Q96M19 166 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TIMM17AQ99595 171 aa6.74□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A8MZ25 164 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 P0DMU3 169 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FAM231AP0DMU4 169 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FAM231CP0DMU5 169 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 IFITM1P13164 125 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WW49 117 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 IGHG2P01859 326 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 CLEC2BQ92478 149 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A0A0B4J2C4 111 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 NXPH4O95158 308 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 FSHBP01225 129 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TMEM141Q96I45 108 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.73□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 M0QXV9 152 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 VCYO14598 125 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LEPROTO15243 131 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ATXN8Q156A1 80 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 Q6Q795 121 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 A0A0J9YXY3 114 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3-20P01619 116 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ZNF702PQ9H963 129 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 MDFICQ9P1T7 246 aa6.72□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 H3BMM0 161 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 J3QLI3 93 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 M0R2P5 195 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 OVOL1O14753 267 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 ZNF56Q15929 161 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 KLK9Q2XQG4 91 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 UBE2WQ96B02 151 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 LITAFQ99732 161 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 SPXQ9BT56 116 aa6.71□□□□□ -1.33
THBS3-211ENST00000541990 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.71□□□□□ -1.33
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