RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 SYCNQ0VAF6 134 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 MIAQ16674 131 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 C9orf85Q96MD7 179 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 A0A0J9YXY3 114 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-204ENST00000538708 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.93□□□□□ -1.3
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