RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 LY6HO94772 140 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DEFB1P60022 68 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 TMEM258P61165 79 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 ZNF580Q9UK33 172 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 LAMA5O15230 3695 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DUX5Q96PT3 197 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 WIPF1O43516 503 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 TRBV12-3P01733 135 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 IGHG2P01859 326 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 ROS1P08922 2347 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 BSNQ9UPA5 3926 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 POLEQ07864 2286 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 CCL21O00585 134 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DNAL4O96015 105 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 NPC2P61916 151 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 Q6JHZ5 121 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 ATMQ13315 3056 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 FAM104AQ969W3 186 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 PIEZO1Q92508 2521 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 IGLV1-40P01703 118 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 MALP21145 153 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 SERP2Q8N6R1 65 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 C2orf48Q96LS8 159 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-215ENST00000537304 TMEM89A2RUT3 159 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 K7EQG2 157 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-11P01762 117 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZSV7 163 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 C3orf56Q8N813 242 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 Q9H8V8 135 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 SPTA1P02549 2419 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 H0YGX0 51 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CRPP02741 224 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 LMO4P61968 165 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ZZEF1O43149 2961 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ABCA4P78363 2273 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CACNA1AO00555 2505 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 A6NDX4 124 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-53P01767 116 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ATRXP46100 2492 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 A8MZ25 164 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 IGKV3-20P01619 116 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CDSNQ15517 529 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 hADV29S1A0JD25 119 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 A8MTW9 85 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 CFHR3Q02985 330 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-215ENST00000537304 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-215ENST00000537304 NDUFC2O95298 119 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms