RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.16□□□□□ -0.62
PACSIN3-210ENST00000533686 PRELID3AQ96N28 172 aa11.15□□□□□ -0.62
PACSIN3-210ENST00000533686 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.15□□□□□ -0.62
PACSIN3-210ENST00000533686 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 NPYP01303 97 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 MT-ND6P03923 174 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 YPEL4Q96NS1 127 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM243Q9BU79 118 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.14□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAH2Q9P225 4427 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087WX48 190 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-30P01768 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-33P01772 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 APCSP02743 223 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 AMTP48728 403 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 C6orf223Q8N319 242 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.13□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS47A8MTI9 375 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM262E9PQX1 116 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TSHBP01222 138 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 KIR2DL4Q99706 377 aa11.12□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 H7C423 109 aa11.11□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TCAPO15273 167 aa11.11□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 GAGE6Q13070 117 aa11.11□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N3U1 123 aa11.11□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.11□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 ESDP10768 282 aa11.1□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 LAGE3Q14657 143 aa11.1□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.1□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GUV1 79 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE2L6O14933 153 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 FCER1GP30273 86 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 MPV17L2Q567V2 206 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 NFE4Q86UQ8 179 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.09□□□□□ -0.63
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.08□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 RTL8CO15255 209 aa11.08□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 RBX1P62877 108 aa11.08□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.08□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.07□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 KLK12Q9UKR0 248 aa11.07□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.07□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.06□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N8P6 123 aa11.06□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N976 141 aa11.06□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.05□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 K7EMI3 77 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 FGF6P10767 208 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB5AP20339 215 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 Q0VG73 95 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.03□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.03□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE2WQ96B02 151 aa11.03□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM18Q96B42 140 aa11.03□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 PRR34Q9NV39 138 aa11.03□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.02□□□□□ -0.64
PACSIN3-210ENST00000533686 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 ENHOQ6UWT2 76 aa11.02□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TM2D2Q9BX73 214 aa11.02□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 Q9HAA7 133 aa11.02□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 CRPP02741 224 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 S100A1P23297 94 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 RMI2Q96E14 147 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM101Q96IK0 257 aa11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 COLCA2A8K830 154 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 MIAQ16674 131 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 ORMDL2Q53FV1 153 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TIMM21Q9BVV7 248 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 COX11Q9Y6N1 276 aa11□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 REG3AQ06141 175 aa10.99□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.99□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.99□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC01546A6NGU7 62 aa10.98□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 SCO1O75880 301 aa10.98□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TNP2Q05952 138 aa10.98□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.98□□□□□ -0.65
PACSIN3-210ENST00000533686 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.98□□□□□ -0.65
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