RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP10-2P60368 255 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 COTL1Q14019 142 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 MPV17L2Q567V2 206 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.68□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.68□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.68□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 AMN1Q8IY45 258 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.67□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R2P9O14990 202 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 PMCHP20382 165 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 RBX1P62877 108 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 Q0VG73 95 aa7.66□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 FRZBQ92765 325 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.66□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 ST20Q9HBF5 79 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 COX11Q9Y6N1 276 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 SMKR1H3BMG3 65 aa7.65□□□□□ -1.18
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UBASH3B-208ENST00000533451 MT-ND4LP03901 98 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A8P05109 93 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 COMMD7Q86VX2 200 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 MRAP2Q96G30 205 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-208ENST00000533451 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.65□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GW15 77 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 F8W036 122 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 GAS8-AS1O95177 125 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 HLA-DQA1P01909 254 aa7.64□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 HBBP68871 147 aa7.64□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 BAALCQ8WXS3 180 aa7.64□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 UQCC3Q6UW78 93 aa7.63□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.63□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.62□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 REG3AQ06141 175 aa7.62□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 ENHOQ6UWT2 76 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N814 137 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.61□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R17O96001 155 aa7.61□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 WFDC2Q14508 124 aa7.61□□□□□ -1.19
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UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM218A2RU14 115 aa7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 D6R8Y8 96 aa7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 BTF3L4Q96K17 158 aa7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 VCYO14598 125 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 TSHBP01222 138 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 FGF6P10767 208 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 ADCYAP1P18509 176 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 GCSHP23434 173 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM101Q96IK0 257 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 KIR2DL4Q99706 377 aa7.59□□□□□ -1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 PKD1P98161 4303 aa7.59□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GUV1 79 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GXF2 115 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 NRACQ8N912 160 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.58□□□□□ -1.2
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