RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 IGLC3P0DOY3 106 aa8.35□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 DPM2O94777 84 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 COTL1Q14019 142 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 FHL2Q14192 279 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 BAALCQ8WXS3 180 aa8.34□□□□□ -1.07
USP17L3-201ENST00000530484 G3V4G9 280 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DEFB130BP0DP73 79 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DEFB130AP0DP74 79 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PLNP26678 52 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 UBE2D3P61077 147 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 UBE2D2P62837 147 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 Q8NAQ8 132 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.33□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 F8VRH5 84 aa8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 IGKCP01834 107 aa8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 NPSP0C0P6 89 aa8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.32□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PMVKQ15126 192 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DEFA6Q01524 100 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 C14orf144Q96I85 54 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.31□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GAGE12JA6NER3 117 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 CRYBA4P53673 196 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GAGE1Q13065 139 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GAGE4Q13068 117 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GAGE5Q13069 117 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GAGE13Q4V321 117 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 CST9LQ9H4G1 147 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.3□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DEFB4AO15263 64 aa8.29□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 LINC00694P0DN24 101 aa8.29□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.29□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 STPG4Q8N801 248 aa8.29□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.29□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 DAD1P61803 113 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 PRO0255Q9UI72 69 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 NOTCH1P46531 2555 aa8.28□□□□□ -1.08
USP17L3-201ENST00000530484 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 COX8AP10176 69 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 MDFIQ99750 246 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 FAM104AQ969W3 186 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 AMELXQ99217 191 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 VCX2Q9H322 139 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 CELA1Q9UNI1 258 aa8.27□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 ATP5G1P05496 136 aa8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 NFE4Q86UQ8 179 aa8.25□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 C11orf86A6NJI1 115 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 H7C423 109 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 DLEU1O43261 78 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 FGF6P10767 208 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 GYPEP15421 78 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM243Q9BU79 118 aa8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 PAX4O43316 350 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 NMUP48645 174 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 CTAG1AP78358 180 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 RETNQ9HD89 108 aa8.23□□□□□ -1.09
USP17L3-201ENST00000530484 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms