RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529285.5

RPS3-213, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 5

Gene RPS3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-213	ENST00000529285	NIT1	Q86X76	327 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	PHOX2A	O14813	284 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	NPY	P01303	97 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	AMT	P48728	403 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285		Q8N3U1	123 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285		A0A087WX48	190 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	GAGE6	Q13070	117 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPS3-213	ENST00000529285	TSHB	P01222	138 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	PKIA	P61925	76 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	YPEL4	Q96NS1	127 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	MT-ND6	P03923	174 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	UBE2L6	O14933	153 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	FCER1G	P30273	86 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	DNAH2	Q9P225	4427 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	PRSS47	A8MTI9	375 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	RBX1	P62877	108 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285		Q8N976	141 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RPS3-213	ENST00000529285	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285		H7C423	109 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	TCAP	O15273	167 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	ESD	P10768	282 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285		A0A1B0GUV1	79 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	RTL8C	O15255	209 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	LAGE3	Q14657	143 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	RAB5A	P20339	215 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285		Q8N8P6	123 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285		Q9HAA7	133 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	FGF6	P10767	208 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS3-213	ENST00000529285	SCO1	O75880	301 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	COLCA2	A8K830	154 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	S100A1	P23297	94 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285		Q0VG73	95 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	CRP	P02741	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	ATP6V1G1	O75348	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285		K7EMI3	77 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	REG3A	Q06141	175 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	RMI2	Q96E14	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	PSCA	O43653	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	TNP2	Q05952	138 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	MIA	Q16674	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms