RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 COTL1Q14019 142 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM104BQ5XKR9 115 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 UQCC3Q6UW78 93 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 MRAP2Q96G30 205 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR34Q9NV39 138 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 HSPG2P98160 4391 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM218A2RU14 115 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 CAMPP49913 170 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 NRACQ8N912 160 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1B0GUV1 79 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1B0GW15 77 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R2P9O14990 202 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 NCR2O95944 276 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 AMTP48728 403 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 Q0VG73 95 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TSHBP01222 138 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 Q8N814 137 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 BAALCQ8WXS3 180 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 ST20Q9HBF5 79 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 COX11Q9Y6N1 276 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 I3L3M4 83 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 LECT2O14960 151 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 MT-ND4LP03901 98 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 HBBP68871 147 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 RMI2Q96E14 147 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00862A6NCI5 91 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 ESDP10768 282 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 PMCHP20382 165 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP10-1P60331 282 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 COMMD7Q86VX2 200 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 CDK2AP2O75956 126 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 MIAQ16674 131 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM242Q9NWH2 141 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 F8W036 122 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 CRPP02741 224 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 APCSP02743 223 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 REG3AQ06141 175 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 VCYO14598 125 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2L6O14933 153 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A8P05109 93 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 SEC11CQ9BY50 192 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 H7C423 109 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R17O96001 155 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 FGF6P10767 208 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 CKS2P33552 79 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-225ENST00000513069 D6R8Y8 96 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFRSF6BO95407 300 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 GCSHP23434 173 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 C20orf78Q9BR46 151 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 NPYP01303 97 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 IMMP2LQ96T52 175 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 XGP55808 180 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 BTF3L4Q96K17 158 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 USP17L23D6RBM5 183 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 HLA-DQA1P01909 254 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 PPBPP02775 128 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 PHOX2AO14813 284 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 KIR2DL4Q99706 377 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 PRSS1P07477 247 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-225ENST00000513069 FCER1GP30273 86 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms