RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 M0R2P5 195 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 PEX7O00628 323 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 CXCL1P09341 107 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMUG1Q53HV7 270 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRNTQ86SH4 94 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01551Q86U37 167 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 RMI2Q96E14 147 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00479Q96M42 142 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAB5BP61020 215 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 C9orf85Q96MD7 179 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPP1R2P9O14990 202 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT3P25713 68 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF876PQ49A33 203 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 CENPWQ5EE01 88 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP82Q8N141 532 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 OCC1Q8TAD7 63 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTH2Q96A98 100 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 FMC1Q96HJ9 113 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 BIN3Q9NQY0 253 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LPAP08519 4548 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 K7EN84 100 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LTAP01374 205 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 S100PP25815 95 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRIP1P50238 77 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 UBE2G1P62253 170 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LAGE3Q14657 143 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 C14orf177Q52M58 125 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 SFRP2Q96HF1 295 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-202ENST00000512290 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHOX2AO14813 284 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 CIDEAO60543 219 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 SH2D1AO60880 128 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 GNG4P50150 75 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNLZQ5SXM8 178 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01600Q96MT4 127 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 IMMP2LQ96T52 175 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 IL36BQ9NZH7 164 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 C5orf52A6NGY3 159 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 H3BVH4 76 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 RHOHQ15669 191 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 BTF3L4Q96K17 158 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 OSTCQ9NRP0 149 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 V9GYV3 84 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 A8MWV9 139 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRGC2P03986 189 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 S100A6P06703 90 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 REG3GQ6UW15 175 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 IFITM10A6NMD0 228 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BKO60814 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BJP06899 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRGC1P0CF51 173 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00694P0DN24 101 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BOP23527 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BBP33778 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BDP58876 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BCP62807 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 BAGE2Q86Y30 109 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 C7orf33Q8WU49 177 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms