RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 MRAP2Q96G30 205 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 S100A6P06703 90 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 MGPP08493 103 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 EVI2AP22794 236 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 CASC10Q5T4H9 136 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 ORMDL3Q8N138 153 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 LCE6AA0A183 80 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 RS1O15537 224 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 PRM2P04554 102 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 DAD1P61803 113 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 SLAQ13239 276 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 ZNF56Q15929 161 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 AMN1Q8IY45 258 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-210ENST00000512194 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 C3orf84H3BNL1 204 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PHOX2AO14813 284 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 DEFB130BP0DP73 79 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 DEFB130AP0DP74 79 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 RAB4AP20338 218 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZTI0 123 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 BAGE3Q86Y29 109 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PRELID3AQ96N28 172 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 U3KQK5 164 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 AGRNO00468 2067 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 D6R8Y8 96 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TCAPO15273 167 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 CRYGDP07320 174 aa5.14□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 Q8NAQ8 132 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 C18orf15Q96N68 181 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 ATP5G1P05496 136 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PMCHP20382 165 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 G0S2P27469 103 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 Q0VG73 95 aa5.13□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 MUC7Q8TAX7 377 aa5.13□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 C20orf78Q9BR46 151 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 JPT2Q9H910 190 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 ST20Q9HBF5 79 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 NIT2Q9NQR4 276 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.12□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-53P01767 116 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA6P56556 154 aa5.12□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 PRAC1Q96KF2 57 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 RETNQ9HD89 108 aa5.12□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 K7EMI3 77 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 K7EQD1 137 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 M0QY20 66 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BKO60814 126 aa5.11□□□□□ -1.59
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HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BJP06899 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 LINC00614P0C842 121 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BOP23527 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BBP33778 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BDP58876 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BCP62807 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 KIR2DL4Q99706 377 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.11□□□□□ -1.59
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