RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087WYN8 130 aa10.42□□□□□ -0.74
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ITGA3-211ENST00000508100 WDR73Q6P4I2 378 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 RASL11AQ6T310 242 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.42□□□□□ -0.74
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ITGA3-211ENST00000508100 XKRY2A2RUG3 117 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 F2Z2F3 143 aa10.4□□□□□ -0.74
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ITGA3-211ENST00000508100 C11orf52Q96A22 123 aa10.4□□□□□ -0.74
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ITGA3-211ENST00000508100 MED9Q9NWA0 146 aa10.32□□□□□ -0.76
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ITGA3-211ENST00000508100 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.29□□□□□ -0.76
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ITGA3-211ENST00000508100 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGA3-211ENST00000508100 NUDT11Q96G61 164 aa10.29□□□□□ -0.76
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ITGA3-211ENST00000508100 APCSP02743 223 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGA3-211ENST00000508100 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
ITGA3-211ENST00000508100 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.28□□□□□ -0.76
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ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 FGF6P10767 208 aa10.27□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 CNFNQ9BYD5 112 aa10.27□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.27□□□□□ -0.77
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ITGA3-211ENST00000508100 BTF3L4Q96K17 158 aa10.26□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 A0A096LNI7 61 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 PEA15Q15121 130 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM101Q96IK0 257 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.24□□□□□ -0.77
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ITGA3-211ENST00000508100 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
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ITGA3-211ENST00000508100 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa10.22□□□□□ -0.77
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