RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 H3BUA1 57 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 RNF182Q8N6D2 247 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 DSCR8Q96T75 97 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 Q9H3A6 140 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 CCL24O00175 119 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 CRIP1P50238 77 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 M0R3E3 92 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 FMC1Q96HJ9 113 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 METTL26Q96S19 204 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 LINC01619G3V211 115 aa8.52□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.52□□□□□ -1.04
ITGA3-208ENST00000506437 hADV29S1A0JD25 119 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF815PA8K554 130 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 BUB3O43684 328 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 H3BRN7 92 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 IGLV2-11P01706 119 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 CFC1BP0CG36 223 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 CFC1P0CG37 223 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 RNF152Q8N8N0 203 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 M0R2P5 195 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 C8orf49Q96NF6 230 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 MDFIQ99750 246 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 U3KQK5 164 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 NDUFA4O00483 81 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 GP9P14770 177 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 KLK9Q2XQG4 91 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF580Q9UK33 172 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 PF4P02776 101 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 Q5XG85 94 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 F6UB75 175 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 LGALS9O00182 355 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 A0A1B0GX51 115 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 F8WDY8 70 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 ATP5LO75964 103 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 GPHB5Q86YW7 130 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM89A2RUT3 159 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 H3BMM0 161 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 UQCRQO14949 82 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 IGKV3-20P01619 116 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 UBE2WQ96B02 151 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 PRAC2D3DTV9 90 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 SPRY2O43597 315 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 HERVK_113P61574 105 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 NACAE9PAV3 2078 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 OVOL1O14753 267 aa8.46□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 RS1O15537 224 aa8.46□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.46□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
ITGA3-208ENST00000506437 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 LINC01620Q4KN68 170 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 DPH3Q96FX2 82 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 C20orf173Q96LM9 149 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 SEC61GP60059 68 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 ERCC8Q13216 396 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 Q1RN00 199 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 Q8TAT8 98 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 RNF185Q96GF1 192 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 C16orf92Q96LL3 132 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 JPT2Q9H910 190 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 U3KQE9 123 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 PSMG4Q5JS54 123 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 C2orf82Q6UX34 121 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-208ENST00000506437 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms