RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 SERF2P84101 59 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L23D6RBM5 183 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 H3BTX0 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 MT-ND4LP03901 98 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RAB5AP20339 215 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RAB2AP61019 212 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RAB5BP61020 215 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RHEBQ15382 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RNF151Q2KHN1 245 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 MUC21Q5SSG8 566 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZQT7 251 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 EPDR1Q9UM22 224 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 PPBPP02775 128 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 BCL2P10415 239 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 PRNTQ86SH4 94 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPV4 95 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 OR7C2O60412 319 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 CRPP02741 224 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 FMC1Q96HJ9 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 NCR2O95944 276 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 CXorf1O96002 111 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 OR5AL1P0C617 328 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 DDTP30046 118 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 RANP62826 216 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 YPEL4Q96NS1 127 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 C5orf52A6NGY3 159 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM12Q96EX1 92 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 A0A087WX48 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 CCL25O15444 150 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GAGE12JA6NER3 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GAGE4Q13068 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GAGE5Q13069 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GAGE13Q4V321 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 VPS25Q9BRG1 176 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 KLK12Q9UKR0 248 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-210ENST00000503258 GCHFRP30047 84 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 Q86TA4 180 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 MUC17Q685J3 4493 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 SCGB1D1O95968 90 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 GCGP01275 180 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 ERASQ7Z444 233 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 TSKUQ8WUA8 353 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 HAMPP81172 84 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 ADIRFQ15847 76 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2WQ96B02 151 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 H7C1H1 209 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 PAGE4O60829 102 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 LTAP01374 205 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 IFNA1P01562 189 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFA6P56556 154 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZRP5 223 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 PANO1I0J062 215 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 TRGC2P03986 189 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 CACNG7P62955 275 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GV72 72 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 B4DEV8 164 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 F6UZH7 168 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 M0QXV9 152 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H2BKO60814 126 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H2BJP06899 126 aa4.81□□□□□ -1.64
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