RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498443.5

TSPAN1-209, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN1, Length 1,071 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-209ENST00000498443 TM2D2Q9BX73 214 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 A6NJY4 79 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 A8MTW9 85 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 E9PLD3 99 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 FABP2P12104 132 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 GCSHP23434 173 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 LINC00315P59091 139 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 PMVKQ15126 192 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZQT7 251 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 CEND1Q8N111 149 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.37□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 BAALCQ8WXS3 180 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 HERC2O95714 4834 aa7.36□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 A8MWV9 139 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 K7EP34 96 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 ZNF56Q15929 161 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 AGRNO00468 2067 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 A0A1W2PPM0 123 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 KNCNA6PVL3 124 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 H3BUT2 72 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 K7ERU9 68 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 RHODO00212 210 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 CRYBA4P53673 196 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 ZNF415Q09FC8 603 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZVH6 145 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 HIST1H4GQ99525 98 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 SPXQ9BT56 116 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN1-209ENST00000498443 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 IGIPA6NJ69 53 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 I3L3M4 83 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 M0QY20 66 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 DEFB131AP59861 70 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 ZNF876PQ49A33 203 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 AMTNQ6UX39 209 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 A0A087WWL8 130 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE12BA1L429 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 C11orf86A6NJI1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 H3BMM0 161 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 M0R2P5 195 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 IGKV3-20P01619 116 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 CRYGDP07320 174 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 CST9LQ9H4G1 147 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 TCTAP57738 103 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 MDFICQ9P1T7 246 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 ZNF815PA8K554 130 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 INSP01308 110 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 FXYD2P54710 66 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 NFE4Q86UQ8 179 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 RAB37Q96AX2 223 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.3□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 A0A1B0GWB2 263 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 A8MZ25 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SPRY2O43597 315 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 C12orf74Q32Q52 190 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 VCX2Q9H322 139 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN1-209ENST00000498443 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 208.4 ms