RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MYCNOSP40205 109 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ORMDL3Q8N138 153 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FMC1Q96HJ9 113 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 OTORQ9NRC9 128 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NOTCH2Q04721 2471 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ATXN8Q156A1 80 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 HIVEP1P15822 2718 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS1P07477 247 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 CD28P10747 220 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PLNP26678 52 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 hADV29S1A0JD25 119 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 D6R8Y8 96 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 Q9H3A6 140 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01620Q4KN68 170 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00643Q86TS7 51 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PEMTQ9UBM1 199 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PGPA6NDG6 321 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF785A8K8V0 405 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BT86 120 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.4□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0U1RRA0 63 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PRX2 142 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM236CP0DP71 79 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNJ2BPP57105 145 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 SFTA2Q6UW10 78 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf38Q86SI9 138 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL24O00175 119 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 SLURP1P55000 103 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf77Q96MU5 243 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCR8Q96T75 97 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 F8P00451 2351 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 AGRNO00468 2067 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 TCRAP04437 139 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 LEPP41159 167 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB136Q30KP8 78 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 MTORP42345 2549 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 EPM2AB3EWF7 344 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BTX0 84 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD7P58549 80 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 HERVK_113P61574 105 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N8P6 123 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 SOCS3O14543 225 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP10-3P60369 221 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 CFC1BP0CG36 223 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 CFC1P0CG37 223 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf82Q6UX34 121 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 UPK3BQ9BT76 320 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 H7C1H1 209 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFC2O95298 119 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-211ENST00000493660 CKS2P33552 79 aa5.36□□□□□ -1.55
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