RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491824.1

HCLS1-210, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-210	ENST00000491824		D6R8Y8	96 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	PSCA	O43653	123 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	PKIA	P61925	76 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824		A0A087WX48	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824		A0A1B0GVY2	172 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	TCAP	O15273	167 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824		Q9UF83	564 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-210	ENST00000491824	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	LAGE3	Q14657	143 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824		K7EMI3	77 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	VCY	O14598	125 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	NCR2	O95944	276 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824		Q9HAA7	133 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	NPY	P01303	97 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	RMI2	Q96E14	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824		I3L3M4	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	TRGC2	P03986	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	NIT1	Q86X76	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-210	ENST00000491824	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.15	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	PMCH	P20382	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824		Q0VG73	95 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	COTL1	Q14019	142 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824		Q8N8P6	123 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824		H7C423	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	CRP	P02741	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	G0S2	P27469	103 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	UBE2L6	O14933	153 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	TSHB	P01222	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	ESD	P10768	282 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	RAB5B	P61020	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824		A0A087WTM6	91 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-210	ENST00000491824	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	AMT	P48728	403 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824		Q8N3U1	123 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824		A0A1B0GUV1	79 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	LINC00614	P0C842	121 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	FCER1G	P30273	86 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	GAGE6	Q13070	117 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	TMEM18	Q96B42	140 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-210	ENST00000491824	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64

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