RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 MT-ND6P03923 174 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 CCL18P55774 89 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 ORMDL3Q8N138 153 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 ST20Q9HBF5 79 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 GAS8-AS1O95177 125 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 TIRAPP58753 221 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 ESRGQ1W209 222 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 NRACQ8N912 160 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 PRELID3AQ96N28 172 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 PHOX2AO14813 284 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 TNFRSF6BO95407 300 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 NPYP01303 97 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT4-210ENST00000491203 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TENM2Q9NT68 2774 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 COLCA2A8K830 154 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LY6G6CO95867 125 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 PMCHP20382 165 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LELP1Q5T871 98 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 C20orf78Q9BR46 151 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 I3L3M4 83 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 VCYO14598 125 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 RAB5AP20339 215 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 S100A12P80511 92 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 COTL1Q14019 142 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 KIR2DL4Q99706 377 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 UPK3BQ9BT76 320 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 LCE6AA0A183 80 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 S100A6P06703 90 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 MALP21145 153 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 FCER1GP30273 86 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 AMTP48728 403 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 IQCJQ1A5X6 159 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM243Q9BU79 118 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 PRSS47A8MTI9 375 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TCAPO15273 167 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TSHBP01222 138 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TRGC2P03986 189 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 Q8N8P6 123 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 Q9H8V8 135 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM262E9PQX1 116 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 UBE2L6O14933 153 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 SIVA1O15304 175 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 PKIAP61925 76 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 GAGE6Q13070 117 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-210ENST00000491203 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 A0A087WX48 190 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV3-30P01768 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV3-33P01772 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 FA2HQ7L5A8 372 aa5.77□□□□□ -1.49
CNOT4-210ENST00000491203 NIT1Q86X76 327 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms