RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 H7C423 109 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 SIVA1O15304 175 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 NPYP01303 97 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 K7EMI3 77 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 PMCHP20382 165 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 ESDP10768 282 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 NIT1Q86X76 327 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 KIR2DL4Q99706 377 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GUV1 79 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TSHBP01222 138 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TTC32Q5I0X7 151 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 Q6ZR54 194 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 LINC01546A6NGU7 62 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 RAB5AP20339 215 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N8P6 123 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM243Q9BU79 118 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 KMT2AQ03164 3969 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 AMTP48728 403 aa8.47□□□□□ -1.05
HDAC1-210ENST00000490081 SCO1O75880 301 aa8.46□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 G0S2P27469 103 aa8.46□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 LAGE3Q14657 143 aa8.46□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.46□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 FCER1GP30273 86 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM18Q96B42 140 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.45□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 A0A087WX48 190 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 LINC01549A6NIU2 74 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 TRGC2P03986 189 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.44□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM262E9PQX1 116 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2L6O14933 153 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 RBX1P62877 108 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.43□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 NPSP0C0P6 89 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 RAB5BP61020 215 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 Q0VG73 95 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 MPV17L2Q567V2 206 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 PRR34Q9NV39 138 aa8.42□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 FGF6P10767 208 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 GAGE6Q13070 117 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 NFE4Q86UQ8 179 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.41□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-30P01768 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-33P01772 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00614P0C842 121 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.4□□□□□ -1.06
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 FA2HQ7L5A8 372 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 C6orf223Q8N319 242 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N3U1 123 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N976 141 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM101Q96IK0 257 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.39□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 M0R2N4 97 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 MIAQ16674 131 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 ENHOQ6UWT2 76 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 TOMM6Q96B49 74 aa8.38□□□□□ -1.07
HDAC1-210ENST00000490081 KLK12Q9UKR0 248 aa8.38□□□□□ -1.07
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