RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489772.5

GGA1-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 2

Gene GGA1, Length 1,384 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-222	ENST00000489772	GAGE6	Q13070	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772		Q8N976	141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	RBX1	P62877	108 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	RIG	Q13278	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	COTL1	Q14019	142 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	UBE2L6	O14933	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	GCSH	P23434	173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	AMT	P48728	403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	LECT2	O14960	151 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	MIA	Q16674	131 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	HSPG2	P98160	4391 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA1-222	ENST00000489772	NCR2	O95944	276 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		A0A1B0GUV1	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		I3L3M4	83 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	RAB4A	P20338	218 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	WFDC2	Q14508	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		A0A1B0GW15	77 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PPP1R17	O96001	155 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	APCS	P02743	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PMCH	P20382	165 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	REG3A	Q06141	175 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	CAMP	P49913	170 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		H7C423	109 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	S100A8	P05109	93 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		F8W036	122 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	SMKR1	H3BMG3	65 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	VCY	O14598	125 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	HBB	P68871	147 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772		Q8N1X5	172 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GGA1-222	ENST00000489772	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	TSHB	P01222	138 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	FGF6	P10767	208 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	XG	P55808	180 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	NRAC	Q8N912	160 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772		A0A1B0GXF2	115 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	ESD	P10768	282 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	FCER1G	P30273	86 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	CKS2	P33552	79 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GGA1-222	ENST00000489772	IFITM2	Q01629	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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