RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB4BP61018 213 aa4.07□□□□□ -1.76
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PRPF40A-210ENST00000489741 MED28Q9H204 178 aa4.07□□□□□ -1.76
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PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf52Q96A22 123 aa4□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1S3Q96PC3 154 aa4□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 PLAC8Q9NZF1 115 aa4□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF40A-210ENST00000489741 HMSDA8MTL9 139 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.99□□□□□ -1.77
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