RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 EDDM3BP56851 147 aa-1.33□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 LAMA3Q16787 3333 aa-1.33□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 LYSTQ99698 3801 aa-1.34□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-1.34□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 K7EQZ3 153 aa-1.34□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
TMEM30CP-202ENST00000489487 PARP14Q460N5 1801 aa-1.35□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 BCL9LQ86UU0 1499 aa-1.35□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.35□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 PLXNB2O15031 1838 aa-1.36□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 TSC2P49815 1807 aa-1.36□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-1.36□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 CMPK1P30085 196 aa-1.37□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 NDUFA12Q9UI09 145 aa-1.37□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-1.37□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 A0A1B0GX51 115 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 M0R2T5 61 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 TNFSF15O95150 251 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 WFDC6Q9BQY6 131 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 COL12A1Q99715 3063 aa-1.38□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 TSTD3H0UI37 97 aa-1.39□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 LINC01545Q5VT33 79 aa-1.39□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 DDA1Q9BW61 102 aa-1.39□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 ERCC6Q03468 1493 aa-1.39□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-1.4□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 HIGD1AQ9Y241 93 aa-1.4□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-1.4□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 SACSQ9NZJ4 4579 aa-1.4□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.41□□□□□ -2.63
TMEM30CP-202ENST00000489487 BICRAQ9NZM4 1560 aa-1.41□□□□□ -2.63
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TMEM30CP-202ENST00000489487 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.41□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 Q5VV11 94 aa-1.41□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 ZNF609O15014 1411 aa-1.42□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.43□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.43□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-1.43□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-1.43□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 GINS2Q9Y248 185 aa-1.43□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 WNK3Q9BYP7 1800 aa-1.43□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 MT1AP04731 61 aa-1.44□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 SPANXCQ9NY87 97 aa-1.44□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 C10orf71Q711Q0 1435 aa-1.44□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 IFT172Q9UG01 1749 aa-1.44□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.44□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 UBE2D1P51668 147 aa-1.45□□□□□ -2.64
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TMEM30CP-202ENST00000489487 NPVFQ9HCQ7 196 aa-1.45□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 SCN3BQ9NY72 215 aa-1.45□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 ITPR1Q14643 2758 aa-1.45□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 RELNP78509 3460 aa-1.45□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 IFNA17P01571 189 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 HAMPP81172 84 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 CFAP126Q5VTH2 177 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 BAGE3Q86Y29 109 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.46□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.47□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 PIRTP0C851 137 aa-1.47□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCDC153Q494R4 210 aa-1.47□□□□□ -2.64
TMEM30CP-202ENST00000489487 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.65
TMEM30CP-202ENST00000489487 MTORP42345 2549 aa-1.48□□□□□ -2.65
TMEM30CP-202ENST00000489487 SPRR1BP22528 89 aa-1.48□□□□□ -2.65
TMEM30CP-202ENST00000489487 SAR1AQ9NR31 198 aa-1.48□□□□□ -2.65
TMEM30CP-202ENST00000489487 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-1.49□□□□□ -2.65
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