RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.18□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.18□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 NAT8Q9UHE5 227 aa9.18□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 USP17L23D6RBM5 183 aa9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 WDR73Q6P4I2 378 aa9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 ISOC2Q96AB3 205 aa9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 CNFNQ9BYD5 112 aa9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.17□□□□□ -0.94
TAPBP-241ENST00000489157 OSTCQ9NRP0 149 aa9.17□□□□□ -0.94
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TAPBP-241ENST00000489157 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
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TAPBP-241ENST00000489157 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.09□□□□□ -0.95
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TAPBP-241ENST00000489157 MRAP2Q96G30 205 aa9.03□□□□□ -0.96
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TAPBP-241ENST00000489157 ST20Q9HBF5 79 aa9.01□□□□□ -0.97
TAPBP-241ENST00000489157 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9□□□□□ -0.97
TAPBP-241ENST00000489157 TMEM218A2RU14 115 aa9□□□□□ -0.97
TAPBP-241ENST00000489157 GAGE12HA6NDE8 117 aa9□□□□□ -0.97
TAPBP-241ENST00000489157 APCSP02743 223 aa9□□□□□ -0.97
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