RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 Q8N814 137 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 NUP35Q8NFH5 326 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 S100A1P23297 94 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 RBX1P62877 108 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 GAGE6Q13070 117 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 WFDC2Q14508 124 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 Q8N976 141 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
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NISCH-209ENST00000485765 RHEBQ15382 184 aa12.58□□□□□ -0.4
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NISCH-209ENST00000485765 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.58□□□□□ -0.4
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NISCH-209ENST00000485765 CTDSP1Q9GZU7 261 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-209ENST00000485765 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-209ENST00000485765 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-209ENST00000485765 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-209ENST00000485765 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-209ENST00000485765 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-209ENST00000485765 AMN1Q8IY45 258 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-209ENST00000485765 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-209ENST00000485765 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.51□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 Q8N1X5 172 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 IMMP2LQ96T52 175 aa12.48□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GXF2 115 aa12.47□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 TSHBP01222 138 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 APCSP02743 223 aa12.47□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 NRACQ8N912 160 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-209ENST00000485765 BTF3L4Q96K17 158 aa12.47□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 CAMPP49913 170 aa12.46□□□□□ -0.41
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NISCH-209ENST00000485765 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
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NISCH-209ENST00000485765 S100A8P05109 93 aa12.44□□□□□ -0.42
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NISCH-209ENST00000485765 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.43□□□□□ -0.42
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NISCH-209ENST00000485765 USP17L23D6RBM5 183 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 FGF6P10767 208 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 HLA-DQA1P01909 254 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
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