RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT1A2P50226 295 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP10-8P60410 259 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 CACNG7P62955 275 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 COX6A2Q02221 97 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 CENPWQ5EE01 88 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR73Q6P4I2 378 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf33Q8WU49 177 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf52Q96A22 123 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2L6O14933 153 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 AMTP48728 403 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 CCL20P78556 96 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 COTL1Q14019 142 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF345Q14585 488 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 MAJINQ3KP22 176 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 NIT2Q9NQR4 276 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGC1P0CF51 173 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 CFAP161Q6P656 301 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 GTSF1Q8WW33 167 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 MANBALQ9NQG1 85 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG13Q9P2W3 67 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB19A4D1S5 217 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 F2Z2F3 143 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 BCL2L11O43521 198 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA1P01562 189 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG4P50150 75 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 STPG4Q8N801 248 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A096LNI7 61 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 XKRY2A2RUG3 117 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 NTF3P20783 257 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 CTRLP40313 264 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZNX1 250 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 GATD1Q8NB37 220 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 BATF3Q9NR55 127 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 HMSDA8MTL9 139 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM12Q96EX1 92 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 CNFNQ9BYD5 112 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF6P10767 208 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXI1Q12951 378 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 TWIST1Q15672 202 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS21Q2M5E4 152 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 PDE6DO43924 150 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 NCR2O95944 276 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 APCSP02743 223 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 XCL1P47992 114 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT11Q96G61 164 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 MED9Q9NWA0 146 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-210ENST00000481231 H7C423 109 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 REG3GQ6UW15 175 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 BIN3Q9NQY0 253 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 BCL2P10415 239 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 CARD19Q96LW7 228 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM231BA6NCW3 169 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX46H3BTG2 121 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EN84 100 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 CCL25O15444 150 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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