RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
ACTB-209ENST00000473257 AMTP48728 403 aa7.03□□□□□ -1.28
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GUV1 79 aa7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 UBE2L6O14933 153 aa7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RNF185Q96GF1 192 aa7.02□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 LPAP08519 4548 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 A0A096LNI7 61 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 H7C1H1 209 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 NTF3P20783 257 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 COTL1Q14019 142 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZNX1 250 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 STPG4Q8N801 248 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 GATD1Q8NB37 220 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 C7orf33Q8WU49 177 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 C11orf52Q96A22 123 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 NIT2Q9NQR4 276 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 UMAD1C9J7I0 102 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 BCL2L11O43521 198 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 CACNG7P62955 275 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 WDR73Q6P4I2 378 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 LINC01600Q96MT4 127 aa7□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 IFNA1P01562 189 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 GNG4P50150 75 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 XCL1P47992 114 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 FOXI1Q12951 378 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 ZNF345Q14585 488 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 TWIST1Q15672 202 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 NUDT11Q96G61 164 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 GAS8-AS1O95177 125 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 TRGC1P0CF51 173 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-8P60410 259 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 CFAP161Q6P656 301 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 MANBALQ9NQG1 85 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 MED9Q9NWA0 146 aa6.97□□□□□ -1.29
ACTB-209ENST00000473257 A0A0J9YXV3 536 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 F2Z2F3 143 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 K7EN84 100 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 FGF6P10767 208 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 CTRLP40313 264 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 RGS21Q2M5E4 152 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 BATF3Q9NR55 127 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 CCL25O15444 150 aa6.95□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 XKRY2A2RUG3 117 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 FAM231BA6NCW3 169 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 HMSDA8MTL9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 APCSP02743 223 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 OCC1Q8TAD7 63 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 CARD19Q96LW7 228 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 TSHBP01222 138 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 BCL2P10415 239 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 CNFNQ9BYD5 112 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PNN7 141 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 PDE6DO43924 150 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 PMCHP20382 165 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 GAGE2BQ13066 116 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 NCR2O95944 276 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 SYCNQ0VAF6 134 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 REG3GQ6UW15 175 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 SMIM12Q96EX1 92 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-209ENST00000473257 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 SMKR1H3BMG3 65 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 ESDP10768 282 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 PTTG1IPP53801 180 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZRP5 223 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 TMEM101Q96IK0 257 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 MUC2Q02817 5179 aa6.88□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 I3L3M4 83 aa6.88□□□□□ -1.31
ACTB-209ENST00000473257 CAMPP49913 170 aa6.88□□□□□ -1.31
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