RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BJP06899 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00614P0C842 121 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BOP23527 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BBP33778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BDP58876 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BCP62807 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LAGE3Q14657 143 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NIT1Q86X76 327 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM18Q96B42 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM243Q9BU79 118 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01546A6NGU7 62 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 PKIAP61925 76 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01549A6NIU2 74 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 H7C423 109 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2L6O14933 153 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 ESDP10768 282 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 UPK3BQ9BT76 320 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM262E9PQX1 116 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 HSBP1O75506 76 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SERF1AO75920 110 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA6P56556 154 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WX48 190 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SIVA1O15304 175 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A6P06703 90 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE6Q13070 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM101Q96IK0 257 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 Q9H8V8 135 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GUV1 79 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EP13 123 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 HBDP02042 147 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 FGF6P10767 208 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TOMM6Q96B49 74 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 NPSP0C0P6 89 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00310P59036 64 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 RBX1P62877 108 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LY6G6CO95867 125 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PMCHL1Q16048 86 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 MPV17L2Q567V2 206 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 ERASQ7Z444 233 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM141Q96I45 108 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMM17AQ99595 171 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-208ENST00000462602 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A096LNJ9 63 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NUPR1O60356 82 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5LO75964 103 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-30P01768 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-33P01772 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC32Q5I0X7 151 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZN92 141 aa6.39□□□□□ -1.39
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