RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM104AQ969W3 186 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 G3V2T6 193 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM250H0YL14 139 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.016e-7■■■■□ 24
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV1-17P01599 117 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CRPP02741 224 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RBX1P62877 108 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 HERVK_113P63121 156 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 DERL3Q96Q80 235 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SOSTQ9BQB4 213 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 GINS4Q9BRT9 223 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 GSKIPQ9P0R6 139 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 IGSF23A1L1A6 192 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 FXYD1O00168 92 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PPBPP02775 128 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 S100A1P23297 94 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 S100A2P29034 98 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFA1P59665 94 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP3R1P63098 170 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 GNG5P63218 68 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 AK3Q9UIJ7 227 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PRNDQ9UKY0 176 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SSR3Q9UNL2 185 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A087WX48 190 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP92A6NM28 416 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC17A3O00476 420 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SCO1O75880 301 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFC2O95298 119 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CXorf1O96002 111 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 INPP1P49441 399 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 IL15RAQ13261 267 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 BTN1A1Q13410 526 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ELOBQ15370 118 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6Q795 121 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ENHOQ6UWT2 76 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CNBD2Q96M20 576 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PFDN5Q99471 154 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM222Q9H0R3 208 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 MED28Q9H204 178 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 OPRK1P41145 380 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LYZP61626 148 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TSKUQ8WUA8 353 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC90BQ9GZT6 254 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ANAPC10Q9UM13 185 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PRE2 83 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R381 172 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 SNAPC5O75971 98 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10J1P30954 320 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 GNG11P61952 73 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CEND1Q8N111 149 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 ORMDL3Q8N138 153 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC32Q9BV29 185 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 WFDC1Q9HC57 220 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R129 80 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 BCL2L11O43521 198 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP5-8O75690 187 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms