RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRAP2Q96G30 205 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TM2D2Q9BX73 214 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM218A2RU14 115 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q0VG73 95 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MPV17L2Q567V2 206 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ENHOQ6UWT2 76 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00862A6NCI5 91 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAS8-AS1O95177 125 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBX1P62877 108 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMN1Q8IY45 258 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLK12Q9UKR0 248 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM262E9PQX1 116 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H7C423 109 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R17O96001 155 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MT-ND4LP03901 98 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADCYAP1P18509 176 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COTL1Q14019 142 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRACQ8N912 160 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM243Q9BU79 118 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC11CQ9BY50 192 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAT1Q14517 4588 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 I3L3M4 83 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EREGO14944 169 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK2AP2O75956 126 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S100A8P05109 93 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ESDP10768 282 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N976 141 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RMI2Q96E14 147 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IMMP2LQ96T52 175 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q9HAA7 133 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C16orf90A8MZG2 172 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HBBP68871 147 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIAQ16674 131 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2WQ96B02 151 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST20Q9HBF5 79 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSHBP01222 138 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMPP49913 170 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE6Q13070 117 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C20orf78Q9BR46 151 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRSS47A8MTI9 375 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F8W036 122 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHOX2AO14813 284 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSCAO43653 123 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPBPP02775 128 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMTP48728 403 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WFDC2Q14508 124 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N814 137 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMKR1H3BMG3 65 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APCSP02743 223 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMCHP20382 165 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REG3AQ06141 175 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COMMD7Q86VX2 200 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTF3L4Q96K17 158 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF6BO95407 300 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRPP02741 224 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms