RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	JPT2	Q9H910	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	PKD1	P98161	4303 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GVY2	172 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2L6	O14933	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q0VG73	95 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	PEA15	Q15121	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	FRZB	Q92765	325 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	GZMB	P10144	247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NTF3	P20783	257 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2D3	P61077	147 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2D2	P62837	147 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A087WTM6	91 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	COTL1	Q14019	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NIT1	Q86X76	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	PPP1R17	O96001	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	S100A8	P05109	93 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CTRL	P40313	264 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RIG	Q13278	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	MIA	Q16674	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q8N976	141 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GUT8	65 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		M0QY20	66 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	ADIRF	Q15847	76 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GVG6	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GW15	77 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550		K7EN84	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	NCR2	O95944	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	APCS	P02743	223 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	PMCH	P20382	165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAGE6	Q13070	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BGR-208	ENST00000452550	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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