RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC11CQ9BY50 192 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 ST20Q9HBF5 79 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GUV1 79 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 I3L3M4 83 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 RBX1P62877 108 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2WQ96B02 151 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 PMCHP20382 165 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 AMTP48728 403 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8N976 141 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf90A8MZG2 172 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
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RABGEF1-204ENST00000442563 IMMP2LQ96T52 175 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR34Q9NV39 138 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 PKHD1P08F94 4074 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 H7C423 109 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 VCYO14598 125 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP10-2P60368 255 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.21□□□□□ -0.61
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RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2L6O14933 153 aa11.2□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 APCSP02743 223 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 MIAQ16674 131 aa11.2□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 SMKR1H3BMG3 65 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 PPBPP02775 128 aa11.19□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 CKS2P33552 79 aa11.19□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 BTF3L4Q96K17 158 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf78Q9BR46 151 aa11.19□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 PHOX2AO14813 284 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8N814 137 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 REG3AQ06141 175 aa11.16□□□□□ -0.62
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RABGEF1-204ENST00000442563 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 D6R8Y8 96 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF6BO95407 300 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DL4Q99706 377 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.14□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 ORMDL3Q8N138 153 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 BAALCQ8WXS3 180 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 TCAPO15273 167 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 WFDC2Q14508 124 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.13□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 RHEBQ15382 184 aa11.12□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.12□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 NPYP01303 97 aa11.11□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 PRELID3AQ96N28 172 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.1□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM101Q96IK0 257 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 LECT2O14960 151 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 GCSHP23434 173 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 C14orf177Q52M58 125 aa11.09□□□□□ -0.63
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RABGEF1-204ENST00000442563 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM18Q96B42 140 aa11.08□□□□□ -0.64
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