RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZUT4 128 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RMI2Q96E14 147 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AQP10Q96PS8 301 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRP2P98164 4655 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFITM10A6NMD0 228 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMPR1BO00238 502 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDCD5O14737 125 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ELK1P19419 428 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2BP63146 152 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZTC4 211 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDPNQ86YL7 162 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB37Q96AX2 223 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HYLS1Q96M11 299 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.89□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BQ15 152 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-12P01611 117 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV2-30P06310 120 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRYGAP11844 174 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CXCL6P80162 114 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP5G2Q06055 141 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6P435 159 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.88□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf70A6NJV1 201 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNGR2O43760 224 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEC11BP0C7V7 166 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAS2R45P59539 299 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNGT1P63211 74 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKR1C1Q04828 323 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC01554Q52M75 96 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OTOSQ8NHW6 89 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YPEL2Q96QA6 119 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CST11Q9H112 138 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL36BQ9NZH7 164 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf94C9JXX5 98 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BT86 120 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R2P5 195 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H2BKO60814 126 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFA3O95167 84 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRACP01848 142 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H2BJP06899 126 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HLA-DMBP28068 263 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK5R1Q15078 307 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8IYB0 196 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPBQ8NG41 125 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.86□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0D9SG52 128 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R129 80 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HRASP01112 189 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF137PP52743 207 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPV17L2Q567V2 206 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KHDC3LQ587J8 217 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCP2Q8IVA1 136 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C7orf33Q8WU49 177 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRELID3AQ96N28 172 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms