RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434703.5

SOX9-AS1-204, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 3,032 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GAGE1Q13065 139 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GAGE4Q13068 117 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GAGE5Q13069 117 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 FHL2Q14192 279 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GAGE13Q4V321 117 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DNAJC30Q96LL9 226 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ZMAT4Q9H898 229 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RNF183Q96D59 192 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ANK2Q01484 3957 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A087WX48 190 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 Q8NAQ8 132 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RETNQ9HD89 108 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 G0S2P27469 103 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CELA1Q9UNI1 258 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 COTL1Q14019 142 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DPM2O94777 84 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGKCP01834 107 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 UBE2D3P61077 147 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 UBE2D2P62837 147 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TIMM17AQ99595 171 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TENM3Q9P273 2699 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 F8VRH5 84 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MIFP14174 115 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DEFA6Q01524 100 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 FAM104AQ969W3 186 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TMEM141Q96I45 108 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.96□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LYRM9A8MSI8 78 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CST9LQ9H4G1 147 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC01549A6NIU2 74 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A8MZ25 164 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CIDEAO60543 219 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PMVKQ15126 192 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00694P0DN24 101 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PLNP26678 52 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DAD1P61803 113 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CTAG1AP78358 180 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C11orf86A6NJI1 115 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NMUP48645 174 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CRYBA4P53673 196 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PCP2Q8IVA1 136 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GYPEP15421 78 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A0J9YY99 117 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 EREGO14944 169 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 COX8AP10176 69 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 VCX2Q9H322 139 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 FGF6P10767 208 aa6.92□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HTN3P15516 51 aa6.92□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 Q6ZUT4 128 aa6.92□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRO0255Q9UI72 69 aa6.92□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.92□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A096LPF7 62 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A0J9YXV3 536 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PAX4O43316 350 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 AMELXQ99217 191 aa6.91□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 K7EIL1 84 aa6.9□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 F5H768 121 aa6.9□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ATP5G1P05496 136 aa6.9□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.9□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.9□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.9□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-204ENST00000434703 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms