RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428458.1

PYGB-202, Transcript of glycogen phosphorylase B, humanhuman

TSL 3

Gene PYGB, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGB-202ENST00000428458 G3V3Q6 166 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 PFDN1O60925 122 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 GAS8-AS1O95177 125 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 AMTP48728 403 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 CFAP161Q6P656 301 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 NIT2Q9NQR4 276 aa7.09□□□□□ -1.27
PYGB-202ENST00000428458 IGLC6P0CF74 106 aa7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.08□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 SMLR1H3BR10 107 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 COTL1Q14019 142 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 REG3GQ6UW15 175 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.07□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.06□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 NTF3P20783 257 aa7.06□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 CACNG7P62955 275 aa7.06□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 CCL20P78556 96 aa7.06□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 CENPWQ5EE01 88 aa7.06□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 RAB19A4D1S5 217 aa7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 XCL1P47992 114 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 FOXI1Q12951 378 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 Q6ZNX1 250 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 GATD1Q8NB37 220 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 GNG13Q9P2W3 67 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 MUC2Q02817 5179 aa7.04□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 F2Z2F3 143 aa7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 IFNA1P01562 189 aa7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 TRGC1P0CF51 173 aa7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 TWIST1Q15672 202 aa7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 Q6ZRP5 223 aa7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PYGB-202ENST00000428458 UMAD1C9J7I0 102 aa7.02□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 FGF6P10767 208 aa7.02□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 GNG4P50150 75 aa7.02□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.02□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 XKRY2A2RUG3 117 aa7.01□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 CCL25O15444 150 aa7.01□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.01□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 C11orf52Q96A22 123 aa7.01□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 CARD19Q96LW7 228 aa7.01□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7□□□□□ -1.29
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PYGB-202ENST00000428458 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.99□□□□□ -1.29
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PYGB-202ENST00000428458 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.99□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.99□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 NUDT11Q96G61 164 aa6.99□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 MANBALQ9NQG1 85 aa6.99□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 A0A1W2PNN7 141 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 CTRLP40313 264 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 SYCNQ0VAF6 134 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 MED9Q9NWA0 146 aa6.98□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 FAM231BA6NCW3 169 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 H7C423 109 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 BCL2L11O43521 198 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 NCR2O95944 276 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 PMCHP20382 165 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 PTTG1IPP53801 180 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 ZNF345Q14585 488 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 TMEM101Q96IK0 257 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 BTF3L4Q96K17 158 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.97□□□□□ -1.29
PYGB-202ENST00000428458 MT-ND6P03923 174 aa6.96□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 BCL2P10415 239 aa6.96□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 I3L3M4 83 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 CAMPP49913 170 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 SS18Q15532 418 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 C1orf137Q5JT78 98 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 SMIM12Q96EX1 92 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 CNFNQ9BYD5 112 aa6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PYGB-202ENST00000428458 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.95□□□□□ -1.3
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