RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413507.3

LACTB-202, Transcript of lactamase beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LACTB, Length 2,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB-202ENST00000413507 PPP1R17O96001 155 aa14.86□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 M0QY20 66 aa14.86□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 A0A0J9YY99 117 aa14.85□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.85□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.85□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.84□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 HERVK_113P61574 105 aa14.84□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 RAX2Q96IS3 184 aa14.84□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 MTORP42345 2549 aa14.83□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 K7EMT4 169 aa14.83□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 PRB1P04280 392 aa14.83□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
LACTB-202ENST00000413507 A0A0J9YXV3 536 aa14.83□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 AKAP9Q99996 3911 aa14.83□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 K7EQG2 157 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 SLURP1P55000 103 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 C9orf85Q96MD7 179 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 J3QQQ9 107 aa14.82□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 LGALS9O00182 355 aa14.81□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 ACANP16112 2415 aa14.81□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.8□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 DEFB131AP59861 70 aa14.8□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TMEM262E9PQX1 116 aa14.8□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 SPXQ9BT56 116 aa14.8□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 CFC1BP0CG36 223 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 CFC1P0CG37 223 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 UBE2D1P51668 147 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 C9JAW5 83 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 USP24Q9UPU5 2620 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TIMM17AQ99595 171 aa14.79□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TMEM141Q96I45 108 aa14.78□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.78□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 A8MZ25 164 aa14.78□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.77□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.77□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 IGHV3-30P01768 117 aa14.77□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.77□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LACTB-202ENST00000413507 NPC2P61916 151 aa14.77□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 AMELXQ99217 191 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 VCX2Q9H322 139 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 LINC01619G3V211 115 aa14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 A4D1N5 150 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 Q6ZSN1 163 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 SLC25A20O43772 301 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.75□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.74□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.74□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 UBE2D3P61077 147 aa14.74□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 UBE2D2P62837 147 aa14.74□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.73□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 I3L3M4 83 aa14.73□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 CD28P10747 220 aa14.73□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 KRTAP10-9P60411 292 aa14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 PRSS2P07478 247 aa14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.72□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.71□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 TMEM223A0PJW6 202 aa14.71□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 ZNF702PQ9H963 129 aa14.71□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 LINC00694P0DN24 101 aa14.71□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LACTB-202ENST00000413507 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 APCP25054 2843 aa14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 ITPR3Q14573 2671 aa14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.7□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 Q1RN00 199 aa14.69□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.69□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 Q6ZSV7 163 aa14.68□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 ELANEP08246 267 aa14.68□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 ODF3Q96PU9 254 aa14.68□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 RHOHQ15669 191 aa14.67□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.67□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.67□□□□□ -0.06
LACTB-202ENST00000413507 FAM104AQ969W3 186 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms