RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTOSQ8NHW6 89 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED23Q9ULK4 1368 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP210LQ5VU65 1888 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLIP1P30622 1438 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA7P01567 189 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOA1P02647 267 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 OCM2P0CE71 109 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAGE2Q86Y30 109 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf109Q9NX04 203 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCR11O14957 56 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA14P01570 189 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOC3P02656 99 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRGC2P03986 189 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBA4P53673 196 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5H6Q8NGV6 325 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLC1Q96QB1 1528 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRDM2Q13029 1718 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JMZ2 1700 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSNA1O43805 119 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPPP2P59282 170 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC9CQ8N5M4 171 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARVBQ9HBI1 364 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL20Q9NYY1 176 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PXDNQ92626 1479 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 FDCSPQ8NFU4 85 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEK7Q8TDX7 302 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MBD5Q9P267 1494 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 EVC2Q86UK5 1308 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFDN6O15212 129 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALB1P05937 261 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLGLB1Q02325 96 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf82Q8WW14 230 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 GINS3Q9BRX5 216 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 V9GYH0 126 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH1P12882 1939 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCC11Q96J66 1382 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPCS3P61009 180 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 BORCS7Q96B45 105 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2J1Q9GZK6 312 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01546A6NGU7 62 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM114B3SHH9 223 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA1P01562 189 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM9BQ8IZU0 186 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNPY4Q8N129 248 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPRMQ9NS64 109 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD109Q6YHK3 1445 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA17P01571 189 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTF3L4Q96K17 158 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPZ2Q9P299 210 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSME4Q14997 1843 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS13CQ709C8 3753 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 BANF1O75531 89 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 STAG3L2P0CL84 134 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 OGNP20774 298 aaKnown RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCL1AP56279 114 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMSQ5H8A3 153 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSGA13Q96PP4 275 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TECPR2O15040 1411 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRP1Q9C000 1473 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 FABP2P12104 132 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS12P25398 132 aaKnown RBP-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCBD1P61457 104 aa-3.64□□□□□ -2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms