RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.88□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.88□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMAT4Q9H898 229 aa2.88□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.88□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 VWFP04275 2813 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS29PA6NIE9 313 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 I3L3M4 83 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PCP2Q8IVA1 136 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 BAALCQ8WXS3 180 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 F8VRH5 84 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-53P01767 116 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 HERV-K104P63124 156 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 MPV17L2Q567V2 206 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IGIPA6NJ69 53 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RHODO00212 210 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RS1O15537 224 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TSHBP01222 138 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 EMP1P54849 157 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZTI0 123 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PTH2Q96A98 100 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.87□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF6P10767 208 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PLNP26678 52 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RIPPLY3P57055 190 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RRN3P1Q2M238 152 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF479Q96JC4 524 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOHQ15669 191 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE12BA1L429 117 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01549A6NIU2 74 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE7O76087 117 aa2.86□□□□□ -1.95
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LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE12IP0CL82 117 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 INSL3P51460 131 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PMVKQ15126 192 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM141Q96I45 108 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMM17AQ99595 171 aa2.86□□□□□ -1.95
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZVH6 145 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNRF2Q8NHG8 242 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IL17DQ8TAD2 202 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf74Q96GX8 76 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 CST9LQ9H4G1 147 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf86A6NJI1 115 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM238C9JI98 176 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 DLEU1O43261 78 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.85□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.85□□□□□ -1.95
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LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.84□□□□□ -1.95
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LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 VAMP3Q15836 100 aa2.84□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.84□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 OR11H2Q8NH07 326 aa2.84□□□□□ -1.95
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE12JA6NER3 117 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EQD1 137 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB130BP0DP73 79 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB130AP0DP74 79 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
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