RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMCO1Q147U7 214 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP2P98164 4655 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWFP04275 2813 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIX6O95475 246 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPH3Q96FX2 82 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFDN5Q99471 154 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 R4GMQ9 66 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R17O96001 155 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZANQ9Y493 2812 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH8P13535 1937 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF609O15014 1411 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI4KAP42356 2102 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEBP20929 6669 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCG22E2RYF7 251 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100A3P33764 101 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL18P55774 89 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q5VSD8 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 AQP10Q96PS8 301 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLXNB2O15031 1838 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 USF3Q68DE3 2245 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 APC2O95996 2303 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R135 149 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf128Q5T292 105 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP152O94986 1710 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PXDNQ92626 1479 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC4P59998 168 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8IZM0 81 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPTA1P02549 2419 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCE1O60756 84 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAMPP81172 84 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG11BQ08648 103 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR2DP22532 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR1AP35321 89 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATRQ13535 2644 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM2Q13029 1718 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOWP63302 87 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8N8P6 123 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 RERGLQ9H628 205 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 V9GYH0 126 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRC1P22897 1456 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNXBP22105 4242 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX17Q14061 63 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms