RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 PMVKQ15126 192 aa9.99□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 KLLNB2CW77 178 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF876PQ49A33 203 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 JMJD1CQ15652 2540 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 LINC00315P59091 139 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 FBN2P35556 2912 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 KNCNA6PVL3 124 aa9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 H3BMM0 161 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDP1-202ENST00000299543 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDP1-202ENST00000299543 A0A087WW49 117 aa9.96□□□□□ -0.81
CTDP1-202ENST00000299543 PRB1P04280 392 aa9.96□□□□□ -0.81
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CTDP1-202ENST00000299543 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.96□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 A0A0J9YX75 114 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 MED14OSP0DP75 135 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 MTORP42345 2549 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 P0DMU3 169 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 FAM231AP0DMU4 169 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 FAM231CP0DMU5 169 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 K7EMT4 169 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 LINC01620Q4KN68 170 aa9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.95□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 A0A0J9YY99 117 aa9.94□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.94□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 PROK1P58294 105 aa9.94□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 ATXN8Q156A1 80 aa9.94□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 Q6ZSV7 163 aa9.94□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.93□□□□□ -0.82
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CTDP1-202ENST00000299543 COX6B1P14854 86 aa9.92□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.92□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.92□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 M0QY20 66 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 A0A0J9YXV3 536 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3-30P01768 117 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 HERVK_113P63121 156 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 SPXQ9BT56 116 aa9.91□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 J3QQQ9 107 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 NXPH4O95158 308 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM141Q96I45 108 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF580Q9UK33 172 aa9.9□□□□□ -0.82
CTDP1-202ENST00000299543 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 C5orf47Q569G3 176 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM101Q96IK0 257 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 LGALS9O00182 355 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 C9orf85Q96MD7 179 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 Q9UF83 564 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 COX6CP09669 75 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM126AQ9H061 195 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 IGHV3-33P01772 117 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 TIMM17AQ99595 171 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 I3L3M4 83 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 CD28P10747 220 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 TRIAP1O43715 76 aa9.86□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.86□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.86□□□□□ -0.83
CTDP1-202ENST00000299543 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.86□□□□□ -0.83
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