RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.46□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 MUC4Q99102 2169 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 PROK1P58294 105 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 A0A0J9YXY3 114 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 DNAL4O96015 105 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 GPHB5Q86YW7 130 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 ZNF575Q86XF7 245 aa11.45□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 IGIPA6NJ69 53 aa11.44□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.44□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 USMG5Q96IX5 58 aa11.44□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.44□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 XCL2Q9UBD3 114 aa11.44□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 IGHV1-69P01742 117 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 ELANEP08246 267 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 COX6B1P14854 86 aa11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 EBI3Q14213 229 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 NRGNQ92686 78 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 UBE2L6O14933 153 aa11.42□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 LINC01546A6NGU7 62 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 LINC01619G3V211 115 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TMEM101Q96IK0 257 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 TMEM223A0PJW6 202 aa11.41□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.4□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 Q9H8V8 135 aa11.4□□□□□ -0.58
USP25-201ENST00000285679 PFN2P35080 140 aa11.4□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 LINC00158P58513 81 aa11.39□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 RHOHQ15669 191 aa11.39□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 CCL19Q99731 98 aa11.39□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 M0QY20 66 aa11.38□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 PRB1P04280 392 aa11.38□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 LGALS9O00182 355 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 A0A0B4J2C4 111 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.36□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.36□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PPR1 153 aa11.36□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 LMO4P61968 165 aa11.36□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 Q9HAA7 133 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 U3KQE9 123 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 MED14OSP0DP75 135 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 A0A087WW49 117 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 PAX4O43316 350 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 CHD6Q8TD26 2715 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 IGHV4-59P01825 116 aa11.35□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 GNLYP22749 145 aa11.34□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 ITPR1Q14643 2758 aa11.34□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.34□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 H7C423 109 aa11.34□□□□□ -0.59
USP25-201ENST00000285679 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.33□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 F8P00451 2351 aa11.33□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 NXPH4O95158 308 aa11.33□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.33□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.33□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 A0A0J9YX75 114 aa11.32□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 ZNF415Q09FC8 603 aa11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 A0A096LPF7 62 aa11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 MIAQ16674 131 aa11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 CRPP02741 224 aa11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 LINC00315P59091 139 aa11.31□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 KLLNB2CW77 178 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 CITED1Q99966 193 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 RNF223E7ERA6 249 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 H3BT86 120 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 Q9UF83 564 aa11.3□□□□□ -0.6
USP25-201ENST00000285679 IGHG2P01859 326 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms