RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 ESDP10768 282 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAGE4Q13068 117 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAGE5Q13069 117 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAGE13Q4V321 117 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 NIT1Q86X76 327 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBE2WQ96B02 151 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM12Q96EX1 92 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 VAMP8Q9BV40 100 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q9UF83 564 aa7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRSS47A8MTI9 375 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 DIRC3C9JPN6 131 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 C14orf177Q52M58 125 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PET117Q6UWS5 81 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNS1Q96KK3 526 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1B0GV50 99 aa7.92□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM238C9JI98 176 aa7.92□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAJINQ3KP22 176 aa7.92□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 BATFQ16520 125 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01600Q96MT4 127 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 VPS25Q9BRG1 176 aa7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM250H0YL14 139 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRSS1P07477 247 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNF151Q2KHN1 245 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 PTH2Q96A98 100 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 NUDT11Q96G61 164 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 C9orf85Q96MD7 179 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1-201ENST00000264244 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 USP17L23D6RBM5 183 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR7C2O60412 319 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q0VG73 95 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADIRFQ15847 76 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00479Q96M42 142 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 GNG13Q9P2W3 67 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 LPAP08519 4548 aa7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087WX48 190 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 K7ERU9 68 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ENHOQ6UWT2 76 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 STPG4Q8N801 248 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 PARLQ9H300 379 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MANBALQ9NQG1 85 aa7.88□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PPV4 95 aa7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CTRLP40313 264 aa7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.87□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CST9LQ9H4G1 147 aa7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 PGPA6NDG6 321 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 A8MWV9 139 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 HLA-DQA1P01909 254 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGLC3P0DOY3 106 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPATA45Q537H7 98 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCE3BQ5TA77 95 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 CST9LP1Q5W188 147 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZN92 141 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 JPT2Q9H910 190 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 OTORQ9NRC9 128 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MUC2Q02817 5179 aa7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SCGB1A1P11684 91 aa7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 TAS2R45P59539 299 aa7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP10-8P60410 259 aa7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 COX19Q49B96 90 aa7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 SGK494Q96LW2 274 aa7.84□□□□□ -1.15
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087WYN8 130 aa7.83□□□□□ -1.16
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A0J9YXV3 536 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms