RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 IGIPA6NJ69 53 aa9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 PMVKQ15126 192 aa9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 RAX2Q96IS3 184 aa9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 B4DSR2 109 aa9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 PSMB8P28062 276 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM238C9JI98 176 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 AZU1P20160 251 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SLURP1P55000 103 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 NPC2P61916 151 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 A0A0J9YX75 114 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 A0A0J9YXV3 536 aa9.24□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 TSPAN13O95857 204 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 TAL2Q16559 108 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SPXQ9BT56 116 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 COX6B1P14854 86 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 DEFB131AP59861 70 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 HERVK_113P61574 105 aa9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 A0A0J9YY99 117 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 A8MZ25 164 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 M0QY20 66 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 CFHR3Q02985 330 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 H3BUA1 57 aa9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 F8W1H4 67 aa9.21□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.21□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.21□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.21□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
SPIN3-232ENST00000639956 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.21□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 J3QQQ9 107 aa9.21□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 PPP1R17O96001 155 aa9.21□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 ATP6V0BQ99437 205 aa9.21□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.2□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 K7EQG2 157 aa9.2□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 MED14OSP0DP75 135 aa9.2□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 SYT8Q8NBV8 401 aa9.2□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NDUFS8O00217 210 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 PRSS2P07478 247 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 CFC1BP0CG36 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 CFC1P0CG37 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 A6NJY4 79 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 K7EMT4 169 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 C9orf85Q96MD7 179 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 VCX2Q9H322 139 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 PRO0461Q9UI25 63 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 AKAP9Q99996 3911 aa9.19□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NXPH4O95158 308 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 USP24Q9UPU5 2620 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 A4D1N5 150 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 LGALS9O00182 355 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TCL1BO95988 128 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 KRTAP10-9P60411 292 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 SIGMAR1Q99720 223 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 Q1RN00 199 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NFE4Q86UQ8 179 aa9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 A0A0U1RRA0 63 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1W2PRX2 142 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 CD28P10747 220 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 Q6ZSN1 163 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-30P01768 117 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 UBE2D1P51668 147 aa9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 J3QR89 54 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 Q6ZSV7 163 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM141Q96I45 108 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TIMM17AQ99595 171 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.16□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 I3L3M4 83 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 NOTCH2Q04721 2471 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 DAND5Q8N907 189 aa9.15□□□□□ -0.94
SPIN3-232ENST00000639956 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms