RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636022.1

CACNA1A-222, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, human

TSL 3

Gene CACNA1A, Length 552 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA1A-222	ENST00000636022	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	CCL25	O15444	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GZMB	P10144	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GCSH	P23434	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	CRIP1	P50238	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LELP1	Q5T871	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PARL	Q9H300	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q9UF83	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PEX7	O00628	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PHOX2A	O14813	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	UBE2G2	P60604	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZNF345	Q14585	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LAGE3	Q14657	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q86TA4	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		A8MWV9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		B4DEV8	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PSCA	O43653	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	NDUFA6	P56556	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q5VSD8	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q8N814	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	JPT2	Q9H910	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q9HAA7	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		H3BVH4	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	BCL2L11	O43521	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ASIP	P42127	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE4	Q13068	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE5	Q13069	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	WFDC2	Q14508	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	C20orf202	A1L168	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022		H0Y8G0	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SH2D1A	O60880	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LTA	P01374	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HAMP	P81172	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	RHEB	Q15382	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	FRZB	Q92765	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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