RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	GNG5	P63218	68 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EBI3	Q14213	229 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	NPB	Q8NG41	125 aa		5.49	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WW49	117 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BVH4	76 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EMI3	77 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5L	O75964	103 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EDN2	P20800	178 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	FCER1G	P30273	86 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GUT8	65 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	RS1	O15537	224 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A20	O43772	301 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TCL1B	O95988	128 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2D1	P51668	147 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PMVK	Q15126	192 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495		U3KQK5	164 aa		5.48	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf61	A6NNL5	157 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	PRND	Q9UKY0	176 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CD7	P09564	240 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYGA	P11844	174 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	FMC1	Q96HJ9	113 aa		5.47	□□□□□ -1.53
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM258	P61165	79 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N1Y9	231 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	RBAKDN	A6NC62	111 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMB8	P28062	276 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		5.46	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	IGF1	P05019	195 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF5	Q99942	180 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS9	O00182	355 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7C	P15954	63 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR25	Q96S07	402 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ELANE	P08246	267 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		Q5XG85	94 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	OVOL1	O14753	267 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS1	P07477	247 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PLN	P26678	52 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	MYCNOS	P40205	109 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PRCD	Q00LT1	54 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		V9GYY9	64 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		D6R8Y8	96 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	PAXX	Q9BUH6	204 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BMM0	161 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAC	P01848	142 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DMB	P28068	263 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	5.43	□□□□□ -1.54	3e-10	■■■■■ 44.4
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N2B8	174 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		5.43	□□□□□ -1.54

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