RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		J3KRW8	73 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		K7EQG2	157 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		M0QY20	66 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TSPAN13	O95857	204 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	INSL3	P51460	131 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0J9YX75	114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		H3BMG7	143 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		H3BUX3	64 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	FSHB	P01225	129 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	MGP	P08493	103 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PSMB8	P28062	276 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PMVK	Q15126	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	LY6E	Q16553	131 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PPP1R17	O96001	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CFC1	P0CG37	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SRD5A1	P18405	259 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	AZU1	P20160	251 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RHOH	Q15669	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	LITAF	Q99732	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	ANK2	Q01484	3957 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193		A0A087WWL8	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFS8	O00217	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	VCY	O14598	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	PF4V1	P10720	104 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	EMP1	P54849	157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms