RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PROK1P58294 105 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBX1P62877 108 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.69□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf86A6NJI1 115 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H4GQ99525 98 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 P0DMU3 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM231AP0DMU4 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM231CP0DMU5 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT8Q8NBV8 401 aa8.68□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPM0 123 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TM2D2Q9BX73 214 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q9UF83 564 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01619G3V211 115 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BMM0 161 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.67□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDZD2O15018 2839 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PRX2 142 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7EP34 96 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N2B8 174 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.66□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E9PLD3 99 aa8.65□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.65□□□□□ -1.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF815PA8K554 130 aa8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCGB2A2Q13296 93 aa8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMVKQ15126 192 aa8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAP30O75446 220 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FABP2P12104 132 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZSV7 163 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C12orf74Q32Q52 190 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.64□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIPPLY3P57055 190 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZSN1 163 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM17AQ99595 171 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEMTQ9UBM1 199 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.63□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIVEP2P31629 2446 aa8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESM1Q9NQ30 184 aa8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM141Q96I45 108 aa8.62□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLL5B9A064 214 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01587Q99440 93 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS25Q9BRG1 176 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 I3L3M4 83 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAX2Q96IS3 184 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XCL2Q9UBD3 114 aa8.61□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAL2Q16559 108 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFTA2Q6UW10 78 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF479Q96JC4 524 aa8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD28P10747 220 aa8.59□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0J9YXV3 536 aa8.59□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R2P5 195 aa8.59□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AZU1P20160 251 aa8.59□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTURNQ8N3F0 131 aa8.59□□□□□ -1.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MTW9 85 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHOHQ15669 191 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HERVK_113P61574 105 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.58□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.58□□□□□ -1.04
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