RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM238C9JI98 176 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 I3L3M4 83 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 TSPAN13O95857 204 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 AMELXQ99217 191 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF702PQ9H963 129 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 ACACBO00763 2458 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 J3QR89 54 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 APOMO95445 188 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC9B-202ENST00000593586 IGHV3-30P01768 117 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 POLQO75417 2590 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 Q6YL49 198 aa14.81□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM223A0PJW6 202 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 KNCNA6PVL3 124 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 UBE2D3P61077 147 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 UBE2D2P62837 147 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 SFTA2Q6UW10 78 aa14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 LEPROTO15243 131 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 FSHBP01225 129 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 CFC1BP0CG36 223 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 CFC1P0CG37 223 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 HTN1P15515 57 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 DEFB131AP59861 70 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 VCX2Q9H322 139 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 RHODO00212 210 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 PSMB2P49721 201 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 SLURP1P55000 103 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC9B-202ENST00000593586 DEFB136Q30KP8 78 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 A0A0J9YXV3 536 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 CENPEQ02224 2701 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 FBN2P35556 2912 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 A8MTW9 85 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 INSL3P51460 131 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 H3BMM0 161 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 PROK1P58294 105 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 SIGMAR1Q99720 223 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 CIDEAO60543 219 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 Q5PR19 223 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 SPATA25Q9BR10 227 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 DUX3Q96PT4 197 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 AZU1P20160 251 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 A8MWV9 139 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 M0R2P5 195 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 PRM2P04554 102 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 CD28P10747 220 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 LRRK2Q5S007 2527 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 FAM104AQ969W3 186 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 A4D1N5 150 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 TCL1BO95988 128 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-202ENST00000593586 PTPN13Q12923 2485 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 FOXI1Q12951 378 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF415Q09FC8 603 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 PEMTQ9UBM1 199 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 NACAE9PAV3 2078 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 CRYBA4P53673 196 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 Q8N2B8 174 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-202ENST00000593586 CR1P17927 2039 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms