RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SFRP2Q96HF1 295 aa8.02□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 APOC3P02656 99 aa8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZSA8 131 aa8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GAGE12JA6NER3 117 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 CIDEAO60543 219 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GAGE1Q13065 139 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GAGE4Q13068 117 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GAGE5Q13069 117 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GAGE13Q4V321 117 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 CT83Q5H943 113 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 UFSP1Q6NVU6 142 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 C15orf54Q8N8G6 183 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 CLRN3Q8NCR9 226 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC30Q96LL9 226 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 SAMD10Q9BYL1 202 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 JPT2Q9H910 190 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 V9GYV3 84 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 MT-ND4LP03901 98 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 CXCL1P09341 107 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 LINC01620Q4KN68 170 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 DNLZQ5SXM8 178 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 XKRY2A2RUG3 117 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R2P9O14990 202 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 GZMBP10144 247 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 ASIPP42127 132 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 SVBPQ8N300 66 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 TM2D2Q9BX73 214 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 A8MWL6 223 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 H3BVH4 76 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 IGLC6P0CF74 106 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 RHEBQ15382 184 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 TSKUQ8WUA8 353 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTIF-208ENST00000590422 A0A087WWC5 75 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 A8MWV9 139 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 J3QL48 77 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V1G1O75348 118 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 SNAPINO95295 136 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 GTSF1Q8WW33 167 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 BAALCQ8WXS3 180 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 IL36BQ9NZH7 164 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 FAM231BA6NCW3 169 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 SNAI2O43623 268 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 OR5AL1P0C617 328 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 SCXQ7RTU7 201 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 CTRLP40313 264 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 NIT1Q86X76 327 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 TPPP3Q9BW30 176 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 A0A087WWL8 130 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 HIGD1CA8MV81 97 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 F2Z2F3 143 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 S100A1P23297 94 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 NUP35Q8NFH5 326 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 CNFNQ9BYD5 112 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 RHODO00212 210 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 WDR73Q6P4I2 378 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 IMMP2LQ96T52 175 aa7.92□□□□□ -1.14
CTIF-208ENST00000590422 KLK12Q9UKR0 248 aa7.92□□□□□ -1.14
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