RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.53□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C18orf15Q96N68 181 aa3.53□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1QBP02746 253 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP5G1P05496 136 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NMBP08949 121 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRYBA4P53673 196 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBE2G2P60604 165 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TDRG1Q3Y452 100 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EPDR1Q9UM22 224 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSG8Q9UQ74 426 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGLV2-8P01709 118 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 P0DMU3 169 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM231AP0DMU4 169 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM231CP0DMU5 169 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SERF2P84101 59 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OR5I1Q13606 314 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM210BQ96KR6 192 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GV50 99 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PPV4 95 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PRE2 83 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HMSDA8MTL9 139 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GCGP01275 180 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00694P0DN24 101 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TAS2R45P59539 299 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRNTQ86SH4 94 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q86TA4 180 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DERL1Q9BUN8 251 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TREM1Q9NP99 234 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NAGKQ9UJ70 344 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PEX7O00628 323 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TAAR5O14804 337 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RS1O15537 224 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CXorf1O96002 111 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MBP02144 154 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF345Q14585 488 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UPK3BQ9BT76 320 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BNG1 76 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SH2D1AO60880 128 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LTAP01374 205 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WFDC2Q14508 124 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC01620Q4KN68 170 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STOML3Q8TAV4 291 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A0D9SG52 128 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAB19A4D1S5 217 aa3.47□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9JCJ5 164 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms