RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 MUC4Q99102 2169 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 J3QKU1 62 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 CCL24O00175 119 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF702PQ9H963 129 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 A0A087WX48 190 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE12BA1L429 117 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TAX1BP3O14907 124 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 HTN3P15516 51 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 SEC11AP67812 179 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 PLNP26678 52 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 NRACQ8N912 160 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 K7EMT4 169 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 K7EQG2 157 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ATP6V0BQ99437 205 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE1Q13065 139 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 MAST4O15021 2626 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE12JA6NER3 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE7O76087 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE12FP0CL80 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE12GP0CL81 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE12IP0CL82 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE4Q13068 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE5Q13069 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE13Q4V321 117 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB125Q8N687 156 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF479Q96JC4 524 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 U3KQK5 164 aa8.42□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 HLA-DRB4P13762 266 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF415Q09FC8 603 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 Q6ZSV7 163 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 A0A096LPF7 62 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 INSP01308 110 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 A0A0J9YXV3 536 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM262E9PQX1 116 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 BAALCQ8WXS3 180 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 C20orf78Q9BR46 151 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 C11orf86A6NJI1 115 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 K7ERU9 68 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PMVKQ15126 192 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 UBE2L6O14933 153 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 ESM1Q9NQ30 184 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 SOCS3O14543 225 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 FGF6P10767 208 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 AZU1P20160 251 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GWB2 263 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01549A6NIU2 74 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 H3BMG7 143 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 I3L3M4 83 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB4AO15263 64 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 H3BMM0 161 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CNFNQ9BYD5 112 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 A6NJY4 79 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CIDEAO60543 219 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CST9LQ9H4G1 147 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 Q9UF83 564 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 VPS13CQ709C8 3753 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 C9orf118A6NHY6 69 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 KLLNB2CW77 178 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.36□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 SPINK8P0C7L1 97 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CEND1Q8N111 149 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 TOMM6Q96B49 74 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 M0R2P5 195 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 DAND5Q8N907 189 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.35□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 A8MZ25 164 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.7 ms